اهداف انجمن جهانی پزشکان صلح و سلامت عبارت است از: 1-کمک به ارتقاء و توسعه سلامت در ابعاد آموزش، پژوهش و پیشگیری و خدمات درمانی در نقاط مختلف جهان.2-ارائه خدمات بهداشتی و درمانی انسان دوستانه به محرومان و مستضعفان جهان.3-حمایت از طرحهای مبارزه با بیماریهای مسری و شایع مغفول مانده خصوصاً در جوامع فقیر.4- حمایت از طرحهای پزشکی مرتبط با پیشگیری و مبارزه با بیماریهای صعبالعلاج.5-کمک به برنامه ریزی آموزشی در راستای تربیت نیروهای انسانی مورد نیاز در عرصههای بهداشتی، پزشکی، صلح و سلامت بهمنظور رفع معضلات ناشی از کمبود کادر پزشکی.6-حمایت از ایجاد و فعالیت تشکلهای علمی و اسلامی در زمینههای مرتبط پزشکی، صلح و سلامت و ارتباط مداوم با آنها.7-حمایت از طرحهای علمی، فرهنگی و اجتماعی گروههای پزشکی مسلمان.
فعالیتهای این انجمن بدین شرح است: 1- شناسایی و جذب متخصصین و مؤسسات تخصصی پزشکی. 2- شناسایی و ایجاد ارتباط علمی فرهنگی بین پزشکان فرهیخته و نخبه با شرایط علمی خاص در جهان. 3- ایجاد بانک اطلاعات شامل کتاب، فیلم، محصولات انفورماتیک، اسناد و مدارک برای ایجاد امکان پژوهش و گسترش علوم پزشکی در جهان اسلام و مناطق محروم بینالمللی. 4-راه اندازی مرکزی منسجم برای ارتباط با پزشکان در راستای اهداف انجمن. 5-معرفی انجمن به مراکز علمی فرهنگی جهان در سازمانهای بینالمللی مرتبط با صلح و سلامت به عنوان یک واحد علمی-فرهنگی-آموزشی. 6-برگزاری همایشهای ملی، منطقهای و بینالمللی در زمینه مسائل ذیربط پزشکی با کیفیت بالای علمی و دانش پزشکی پیشرفته به مثابه بستری برای افزایش ارتباطات. 7-راه اندازی مراکز مرتبط در نقاط مختلف جهان به عنوان شعبه ای از فعالیتهای انجمن. 8-انجام فعالیتهای مطالعاتی و تحقیقاتی کاربردی مشترک با پزشکان در کشورهای مختلف جهان در زمینه پزشکی و سلامت. 9-تبیین دیدگاههای اسلام نسبت به مسائل روز پزشکی. 10-معرفی منابع غنی علمی دانشمندان اسلامی در علوم پزشکی.